Trois universités, Université de Provence, Université de la Méditerranée et Université de Droit, d'Economie et des Sciences, collaborent étroitement avec les plus grands organismes de recherche (CHU (Centre Hospitalier Universitaire) : APHM (Assistance Publique Hôpitaux Marseille), CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique), INSERM (Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale), INRA (Institut National de la Recherche Agronomique), IFREMER (Institut Français de la Recherche pour l'Exploitation de la MER), INRIA (Institut National de la Recherche en Informatique et en Automatique), CEA (Commissariat à l'Énergie Atomique) …) et placent Marseille en 2 ème position après Paris en matière de recherche publique.
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